تتكون الهيئة التنفيذية لجامعة انواكشوط من رئيس ونائبين للرئيس وأمين عام.
ويرأس رئيس جامعة نواكشوط كافة هيئات الجامعة ويضمن:
تسيير الجامعة.
تطبيق القوانين والنظم المسيرة للجامعة
تسيير المصادر البشرية للجامعة
تسيير موارد الجامعة.
الأمر بالصرف وتسيير الميزانية.
رئيس الجامعة هو الذي يمثلها لدى كافة الهيئات، ويضمن التنسيق مع الجهات الوصية..
يوقع كافة الاتفاقيات الملزمة، واتفاقيات التعاون.
يرأس لجنة تسير معينة من طرف الجمعية العامة للجامعة.
يوقع محاضر الجمعية العامة.
